Farmfood er godkendt af fødevareregionen efter biproduktforordningen. Vi har et egenkontrolprogram, der er opbygget efter HACCP princippet, hvor de kritiske styringspunkter for de forskellige arbejdsgange fastlægges. Der er etableret et overvågningssystem, der sikrer at de kritiske grænseværdier overholdes og det fastlægges ligeledes, hvilken korrigerende handling, der skal til hvis grænserne overskrides. Der skal desuden være sporbarhed og dokumentation.

Farmfoods eget laboratorium udtager løbende stikprøver af færdigvarerne, som analyseres såvel kemisk som bakteriologisk.